傳統的RNA-Seq方法通過分析整個細胞群體的RNA,能得到的僅僅是一個整體檢測的平均值,并不能代表每個單細胞的轉錄組。通過每次分析單個細胞的轉錄組,可以捕獲樣品中的異質性,并從生物體的基本單位 — 細胞上進行研究。
單細胞RNA-seq的基本流程如下:①從組織分裂得到單細胞懸液;②分離單個細胞;③捕獲并擴增細胞內RNA;④構建測序文庫并測序。

單細胞RNA-seq基本流程圖
應用方向
? 大規模細胞圖譜構建
? 細胞亞群細化&稀有細胞類型鑒定
? 腫瘤方向研究
? 干細胞發育及分化研究
? 免疫方向研究
? 發育生物學
? 生物標志物/疾病分型
? ……
中科普瑞單細胞平臺介紹—10X Genomics單細胞轉錄組測序服務
10X Genomics的Chromium系統利用油包水的微反應體系,通過序列標簽區別群體中的不同細胞和轉錄本,獲得單細胞水平的數字化基因表達譜,可實現數千甚至數萬個單細胞群體分析,解決常規scRNA-seq方法在通量或擴展性方面存在的不足,為單細胞研究開拓新的思路。

技術流程
將樣本分配到100,000s到1000,000s微反應體系,每個微反應體系含有一種特定的DNA序列標記。
含有barcode信息的凝膠珠子首先與樣品和酶的混合物混合,然后與位于微流體“雙十字”連接中的油表面活性劑溶液結合。
GEMs (包含樣品、酶、凝膠珠子的混合物油滴)流到儲液器中并進行收集。凝膠珠子溶解釋放barcode序列,開始對樣本進行標記。將每個液滴中含有barcode信息的產物混合。然后構建標準測序文庫。

服務優勢
靈活的細胞選取范圍:每個樣本可檢測細胞數范圍為1000-9000個。
超高的細胞捕獲效率:單個樣本細胞捕獲率高達65%,高效獲取每個細胞的基因表達信息。
應用于各層面研究:可成功應用于識別細胞周期、腫瘤細胞異質性、鑒定罕見細胞類型、免疫細胞分型、疾病分型等領域。
樣本酶解和組織保存解決方案:中科普瑞在近兩年的單細胞服務中積累了豐富的經驗,為您的單細胞研究服務保駕護航。
樣本要求
類型: 新鮮組織,原代細胞,細胞系等。
來源: 血液提取、磁珠富集、流式富集、組織解離等。

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