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BD平臺開展海洋生物單細胞研究的優勢

2鹽離子濃度、金屬離子濃度以及其它干擾物質

10x Genomics平臺是將細胞、逆轉錄反應Mix、引物等成分通過包裹成油包水液滴的形式，實現在一個封閉的微型反應系統內，完成單個細胞轉錄組的逆轉錄反應。細胞緩沖液中或細胞中的高濃度鹽離子、金屬離子、殘留的EDTA和DNase I等成分也都會被包裹在液滴內，從而影響逆轉錄酶的活性，導致反轉錄失敗或者低效。

BD Rhapsody平臺是半開放的體系，通過細胞和磁珠共同沉降到微孔板里，來達到捕獲單細胞轉錄組的效果。細胞經過裂解后，所有干擾物質包括金屬離子、細胞重懸溶液中含有的EDTA和DNase I等都會被清洗，只留下干凈的mRNA被磁珠回收。在干凈的反應體系中，逆轉錄酶的活性不受抑制，反轉錄反應能正常進行。

2細胞偏小、mRNA含量偏低

無論是微流控技術還是微孔捕獲技術，對于較小的細胞，由于細胞捕獲過程中（被包入油滴或者落入微孔）的動力學特征的影響，有可能造成一定的細胞數目偏差。10x Genomics平臺是封閉系統，一次性快速的完成液滴包裹實驗，無法調整實驗參數，直到測序完成后，通過生物信息學分析才能知道捕獲的細胞數目。如果利用BD Rhapsody 平臺的實時成像監控系統，可以通過監控現場的熒光/明場的掃描結果，調整細胞沉降的實驗參數，從而把控實驗質量，保證單細胞測序實驗能夠按照預期順利有序地進行。

中科普瑞的海洋生物單細胞項目實例

圖 中科普瑞單細胞平臺利用BD Rhapsody系統完成的海洋生物單細胞測序項目的聚類分群結果。大量實驗結果顯示，通過BD單細胞測序，可以輕松解析海洋生物體內單細胞水平的異質性。結合mRNA轉錄本的功能和人工注釋細胞類型，海洋生物的研究盡在掌控。