近年來(lái)，蛋白質(zhì)作為生命活動(dòng)的功能執(zhí)行體，其研究?jī)r(jià)值越來(lái)越受到重視，將蛋白組學(xué)和基因組學(xué)研究結(jié)合在一起進(jìn)行多維度單細(xì)胞信息解讀，不僅能夠更好地觀察細(xì)胞之間的異質(zhì)性，同時(shí)也能夠更清楚地識(shí)別特定細(xì)胞及其功能。BD Abseq 與BD RhapsodyTM 高通量單細(xì)胞捕獲系統(tǒng)結(jié)合使用的方式，能夠使研究人員同時(shí)分析數(shù)千個(gè)單細(xì)胞中的 RNA 和蛋白質(zhì)，完整揭示出生物學(xué)系統(tǒng)中基因和蛋白質(zhì)的作用。
AbSeq是利用特異性抗體核酸偶聯(lián)結(jié)構(gòu)，將蛋白表達(dá)量轉(zhuǎn)化為核酸含量，然后通過(guò)高通量測(cè)序手段檢測(cè)蛋白含量。
抗體核酸偶聯(lián)結(jié)構(gòu)圖
技術(shù)流程
BD Rhapsody?融合了 WTA 和 Abseq 兩種單細(xì)胞檢測(cè)技術(shù)，將蛋白組和轉(zhuǎn)錄組的檢測(cè)過(guò)程在單細(xì)胞水平很好地進(jìn)行了融合。細(xì)胞經(jīng)過(guò) BD AbSeq Ab-oligos 標(biāo)記后，通過(guò) BD Rhapsody? 微孔沉降技術(shù)捕獲單細(xì)胞全轉(zhuǎn)錄組 mRNA 和 Ab-oligo。然后，利用文庫(kù)擴(kuò)增試劑對(duì)同一樣本產(chǎn)生平行的 RNA 和 BD AbSeq 測(cè)序文庫(kù)。經(jīng)過(guò)高通量測(cè)序后獲得 RNA 和蛋白表達(dá)的數(shù)據(jù)，并使用特定分析軟件 SeqGeqTM 進(jìn)行數(shù)據(jù)分析。
實(shí)驗(yàn)技術(shù)流程圖
技術(shù)優(yōu)勢(shì)
? 可對(duì)同一個(gè)樣本，在一次實(shí)驗(yàn)中得到高通量mRNA 和 蛋白表達(dá)量數(shù)據(jù)
? 蛋白的表達(dá)量數(shù)據(jù)可彌補(bǔ)mRNA中不能檢測(cè)到的信息
? 依據(jù)蛋白的表達(dá)量數(shù)據(jù)更加準(zhǔn)確可靠的鑒定細(xì)胞亞群
應(yīng)用方向
? 腫瘤異質(zhì)性
? 組織發(fā)育機(jī)制
? 治療干預(yù)反應(yīng)
? 生物標(biāo)志物發(fā)現(xiàn)
抗體列表
目前 BD 公司推出的 Abseq 抗體約有400余種（人和小鼠），可以滿足大部分實(shí)驗(yàn)需求。部分列表如下（如需全部抗體目錄，請(qǐng)咨詢中科普瑞當(dāng)?shù)劁N售人員）。
Calalog No. | Product Description | Specificity |
940000 | Hu CD3 Ab-O AHS0033 SK7 25Tst | CD3 |
940001 | Hu CD4 Ab-O AHS0032 SK3 25Tst | CD4 |
940002 | Hu CD45 Ab-O AHS0040 HI30 25Tst | CD45 |
940003 | Hu CD8 Ab-O AHS0027 RPA-T8 25Tst | CD8 |
940004 | Hu CD19 Ab-O AHS0030 SJ25C1 25Tst | CD19 |
940005 | Hu CD14 Ab-O AHS0037 MPHIP9 25Tst | CD14 |
940006 | Hu CD16 Ab-O AHS0053 3G8 25Tst | CD16 |
940007 | Hu CD56 Ab-O AHS0019 NCAM16.2 25Tst | CD56 |
940008 | Hu CD11b Ab-O AHS0005 M1/70 25Tst | CD11b |
940009 | Hu CD25 Ab-O AHS0026 2A3 25Tst | CD25 |
940010 | Hu HLA-DR Ab-O AHS0035 G46-6 25Tst | HLA-DR |
940011 | Hu CD45RA Ab-O AHS0009 HI100 25Tst | CD45RA |
940012 | Hu CD127 Ab-O AHS0028 HIL-7R-M21 25Tst | CD127 |
940013 | Hu CD38 Ab-O AHS0022 HIT2 25Tst | CD38 |
940014 | Hu CD197 Ab-O AHS0007 3D12 25Tst | CD197 |
940015 | Hu CD279 Ab-O AHS0014 EH12.1 25Tst | CD279 |
940016 | Hu CD20 Ab-O AHS0008 2H7 25Tst | CD20 |
940017 | Hu CD28 Ab-O AHS0024 CD28.2 25Tst | CD28 |
940018 | Hu CD27 Ab-O AHS0025 M-T271 25Tst | CD27 |
940019 | Hu CD69 Ab-O AHS0010 FN50 25Tst | CD69 |
940020 | Hu CD123 Ab-O AHS0020 7G3 25Tst | CD123 |
940021 | Hu CD34 Ab-O AHS0061 581 25Tst | CD34 |
940022 | Hu CD45RO Ab-O AHS0036 UCHL1 25Tst | CD45RO |
940024 | Hu CD11c Ab-O AHS0056 B-LY6 25Tst | CD11c |
940025 | Hu CD86 Ab-O AHS0057 2331 (FUN-1) 25Tst | CD86 |
940026 | Hu IgD Ab-O AHS0058 IA6-2 25Tst | IgD |
940027 | Hu IgG Ab-O AHS0059 G18-145 25Tst | IgG |
940028 | Hu CD24 Ab-O AHS0042 ML5 25Tst | CD24 |
940029 | Hu CD7 Ab-O AHS0043 M-T701 25Tst | CD7 |
940030 | Hu CD183 Ab-O AHS0031 1C6/CXCR3 25Tst | CD183 |
940031 | Hu CD33 Ab-O AHS0044 WM53 25Tst | CD33 |
940032 | Hu CD90 Ab-O AHS0045 5E10 25Tst | CD90 |
940033 | Hu CD196 (CCR6) Ab-O AHS0034 11A9 25Tst | CD196 (CCR6) |
940034 | Hu CD152 Ab-O AHS0017 BNI3 25Tst | CD152 |
940035 | Hu CD274 Ab-O AHS0004 MIH1 25Tst | CD274 |
940036 | Hu CD80 Ab-O AHS0046 L307.4 25Tst | CD80 |
940037 | Hu CD95 Ab-O AHS0023 DX2 25Tst | CD95 |
結(jié)果展示
單細(xì)胞水平上蛋白質(zhì)與基因表達(dá)的相關(guān)性圖
覆蓋兩種蛋白標(biāo)記物（CD4 和 CD45RA）的t-SNE 分析表達(dá)熱圖
